新研究:生成式人工智能可快速 分析染色质三维结构
据介绍,染色质是细胞核内由脱氧核糖核酸(DNA)和蛋白质等形成的复合物,具备复杂结构,使得展开后约2米长的DNA链条能够塞入直径仅为百分之一毫米的细胞核中。染色质的结构差异会导致被有效表达的基因不同,从而影响细胞功能。
传统上通过实验来分析染色质结构的方法费时费力,需要约一周时间才能得到一个细胞的数据。美国麻省理工学院研究人员日前在美国《科学进展》杂志上发表论文说,利用生成式人工智能可快速、准确分析细胞中染色质结构,将这个时间缩短到若干分钟。
研究人员开发出名为ChromoGen的人工智能模型,它由一个深度学习模型和一个生成式人工智能模型组成。前者经过训练可“读取”基因组,分析DNA序列和染色质中的相关信息。后者则可根据相关信息给出染色质结构,此前已用超过1100万个染色质结构对其进行训练。当二者集成时,可针对不同细胞环境,分析确定相关的染色质结构。
研究人员表示,这有助于更好地探索染色质三维结构如何影响单个细胞的基因表达模式和功能,从而推动生物学等领域研究。
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责任编辑:孙知兵
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