天天微头条丨首个!华大基因助力绘制豆科植物百脉根根尖单细胞图谱
豆科植物根系在固氮过程中起着重要作用。然而,豆科植物根中不同类型细胞基因表达及其功能尚不清楚。
近日,华大基因(300676)助力中国农业科学院生物技术研究所、西华师范大学等单位,共同完成豆科植物百脉根根尖单细胞图谱绘制合作研究,于Journal of Integrative Plant Biology发表“Single-cell RNA-seq of Lotus japonicus provide insights into identification and function of root cell types of legume”的研究论文。(点击文末“阅读原文”可查看论文原文)。
该研究首次绘制豆科植物百脉根的根尖单细胞表达图谱,利用原位杂交鉴定出了根尖的主要细胞类型,分析了各个细胞类型的潜在功能,发现了新的细胞类型特异基因,对研究豆科植物根系发育、生物固氮以及生物育种都具有重要意义。
(相关资料图)
这项研究也是继华大基因参与发表水稻根部单细胞图谱绘制研究后的又一力作(Molecular Plant,2021)。
主要研究成果
01
百脉根根尖单细胞图谱绘制
该研究利用高通量单细胞分选平台对百脉根根尖解离出的22,688个原生质体进行了转录组测序,得到了高质量的测序结果,并通过细胞类型特异表达基因鉴定出了根尖7种主要细胞类型。
02
功能和进化分析
研究团队进一步分析了不同细胞类型的功能,发现九种激素和固氮相关基因在不同细胞类型呈现不同表达规律。另外,与拟南芥根尖单细胞图谱比较分析后,研究团队进一步发现:不同植物细胞类型的功能以及保守性及差异性。
图2 百脉根根尖细胞类型功能及进化分析结果图
中国农业科学院生物技术研究所吴燕民研究员和梁哲研究员为论文通讯作者,生物所孙占敏博士、华大基因姜三杰博士和西华师范大学王丹博士为论文第一作者。该工作得到了国家科技基础资源调查专项、国家自然科学基金、重庆自然科学基金、中国农业科学院创新工程项目资助。
参考文献:
[1]Sun, Z.M., Jiang, S.J., Wang, D., L,i L.X., Liu, B.X., Ran, Q.F., Hu, L.Z., Xiong, J.B., Tang, Y.X., Gu, X.F., Wu, Y.M,, Liang, Z. (2022). Single-cell RNA-seq of Lotus japonicus provide insights into identification and function of root cell types of legume. J Integr Plant Biol. doi: 10.1111/jipb.13435
[2]Liu, Q., Liang, Z., Feng, D., Jiang, S.J., Wang, Y.F., Du, Z.Y,, Li, R.X,, Hu, G.H., Zhang, P.X., Ma, Y.F., et al. (2021). Transcriptional landscape of rice roots at the single-cell resolution. Molecular Plant 14: 384-394.
关键词: 豆科植物
责任编辑:孙知兵
免责声明:本文仅代表作者个人观点,与太平洋财富网无关。其原创性以及文中陈述文字和内容未经本站证实,对本文以及其中全部或者部分内容、文字的真实性、完整性、及时性本站不作任何保证或承诺,请读者仅作参考,并请自行核实相关内容。
如有问题,请联系我们!
- 天天微头条丨首个!华大基因助力绘制豆科植2022-12-28
- 环球速读:华夏幸福最后一名“平安系”董事2022-12-28
- 最新快讯!华夏幸福拟124亿向华润置地转让南2022-12-28
- 复星与辉瑞的抗疫启示2022-12-28
- 为什么说魅族社区是魅族品牌背后的“大本营2022-12-28
- 当前快看:首批26个试点项目!资本市场金融2022-12-28
- 【环球财经】海指12月28日微涨0.02%2022-12-28
- 港股内银股集体走强,建设银行涨超4%2022-12-28
- 环球短讯!港股通医药ETF(513200.SH)涨1.2022-12-28
- 焦点热议:【龙虎榜】意华股份12月28日成交2022-12-28
- 【聚看点】港股异动 | 部分抗疫概念股下2022-12-28
- 世界热资讯!先声再康江苏药业退出南银法巴2022-12-28
- 焦点滚动:【券商聚焦】海通国际:持续关注2022-12-28
- 万科完成发行37亿中票,用于补流及项目建设2022-12-28
- 环球微头条丨港股概念追踪 | 全球最大漂2022-12-28
- “21奥园债”利息支付再展期半年2022-12-28
- 平安银行星云物联计划接入设备数突破2000万2022-12-28
- 美赞臣“罐盖新生”项目获“人民企业社会责2022-12-28
- Mysteel晚餐:钢坯亏损158元,明年1月高炉2022-12-28
- 年末消费多?黄执中教你用平安银行信用卡签2022-12-28
- 上投摩根基金王大智:养老议题要关注年轻人2022-12-28
- 天天要闻:因未按基金合同约定进行止损等 2022-12-28
- 每日热文:深圳控股11月销售额11.43亿元,环2022-12-28
- 北向资金净买入39.18亿元 中国平安净买入52022-12-28
- 焦点热讯:远洋集团成功发行13.03亿元REITs产品2022-12-28
- 当前通讯!瑞尔集团港股涨16.23%2022-12-28
- 喜报!中国长城研究院荣获“深圳市重点企业2022-12-28
- 快消息!中融国际信托退出天津静海万达49%2022-12-28
- 知乎港股跌8.33%2022-12-28
- 简一×《时间的朋友》,带来成品交付新启发2022-12-28
精彩推荐
- 环球速读:华夏幸福最后一名“平安系”...
- 最新快讯!华夏幸福拟124亿向华润置地转...
- 港股内银股集体走强,建设银行涨超4%
- 环球短讯!港股通医药ETF(513200.SH)...
- 【聚看点】港股异动 | 部分抗疫概念股...
- 焦点滚动:【券商聚焦】海通国际:持续关...
- 万科完成发行37亿中票,用于补流及项目建设
- 环球微头条丨港股概念追踪 | 全球最大...
- “21奥园债”利息支付再展期半年
- Mysteel晚餐:钢坯亏损158元,明年1月高...
- 每日热文:深圳控股11月销售额11.43亿元...
- 焦点热讯:远洋集团成功发行13.03亿元REITs产品
- 当前通讯!瑞尔集团港股涨16.23%
- 快消息!中融国际信托退出天津静海万达4...
- 知乎港股跌8.33%