华大基因家蚕超级泛基因组图谱绘就入选2022国内十大科技新闻

近日,由中央广播电视总台发布的2022年度国内、国际十大科技新闻名单正式揭晓。其中,西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕桑产业技术体系首席科学家代方银教授团队联合华大基因等单位合作完成的家蚕超级泛基因组项目成功入选2022年度国内十大科技新闻。

研究团队通过对1078份蚕种质资源进行了深度短读长测序,对其中545份代表性资源进行了长读长测序,产生55.57T基因组数据,组装了545个蚕的高质量基因组,对100个基因组进行了基因注释,鉴定到4,300余万个SNP、930余万个Indel、340余万个结构变异(SV)和7,308个新基因(家族),绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱。该图谱包含了目前全球最全面的家蚕与野桑蚕基因组信息,是全球动植物领域样本量最大的长读长泛基因组。此外,研究团队在全球率先构建家蚕基因数据库,对于开启家蚕设计育种,赋能“改造家蚕、多元利用”等,将有重要深远的意义。

华大基因千蚕高精度基因遗传变异图谱入选2022国内十大科技新闻

由于家蚕可视遗传性状丰富,基因组大小合适,对家蚕的基因组研究将对害虫防治等具有重要应用价值。早在2003年,日本率先开启了家蚕基因组计划,该计划曾与曼哈顿原子弹计划、阿波罗计划并称为20世纪三大科学计划的国际人类基因组计划。

作为我国基因行业的奠基者,华大基因曾助力完成人类基因组计划1%测序工作和水稻基因组项目,拥有成熟稳定的基因组测序能力和世界领先的组装拼接技术。为了让中国重新掌握桑蚕业的话语权,华大基因积极加大研发资源投入,为西南大学家蚕基因组研究团队提供技术支持,同时在测序组装、信息分析等方面提供专业支持。

时至今日,随着国内外动植物基因组研究的不断深入,越来越多物种的泛基因组被相继公布,泛基因组现已在动植物基因组学研究中被广泛用于更为全面地评估物种内遗传多样性。华大基因基于自主研发的多组学技术Stereo-seq,为研究团队提供“亚细胞级分辨率”和“厘米级全景视场”的技术,并同时实现基因与影像的同时分析。凭借在动植物基因组学的研究经验总结,华大基因为研究团队提供长读长+短读长测序结合Hi-C技术研究策略。

未来,华大基因将为更多科研机构、企事业单位等提供多组学技术支持与服务,携手研究新兴模式生物,不断优化升级多组学技术,为基因组变异和优良基因的深度挖掘提供科学支撑,助力动植物育种新突破。

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